Pagerintas 1 tipo diabeto genetinės rizikos balas

fonas

Ankstyva ikiklinikinė 1 tipo diabeto (T1D) diagnozė gali padėti išvengti prevencijos ir sumažinti sergamumą bei su tuo susijusias sveikatos priežiūros išlaidas.

Autoantikūnų testai šiuo metu atliekami kūdikiams, kurie turi būti tikrinami dėl būsimos T1D išsivystymo rizikos. Tačiau jie naudojami klinikiniuose tyrimuose. Jie nėra laikomi ekonomiškai efektyviais naudoti įprastoje praktikoje. Suaugusiems, sergantiems besiformuojančiu diabetu, diabeto tipas nebūtinai gali būti akivaizdus iš klinikinių savybių. Kai kuriais atvejais, norint patikimai diagnozuoti, nepakanka papildomų tyrimų, tokių kaip C-peptidų ir autoantikūnų patikra, sako neseniai paskelbto naujo genetinės rizikos balo [1] autoriai.

T1D turi didelę dalį paveldimų komponentų, tai įrodo dvynių iki 70% atitikties rodiklis ir 8% brolių ir seserų rizika. Informacinė genetinės rizikos balų vertė skiriasi priklausomai nuo SNP (vieno nukleotido polimorfizmų) tipo ir skaičiaus, į kuriuos atsižvelgiama, apribojimo dėl išlaidų ir imties dydžio bei rezultatų skaičiavimo metodų.

T1D riziką daugiausia lemia kai kurių labai stipriai susijusių žmogaus leukocitų antigeno (HLA) lokusų variacijos. Genetinės rizikos baluose (GRS), kurie iki šiol buvo gauti dėl T1D ligos, nėra visos žinomos informacijos apie ne ŽLA lokusus, ypač apie ŽLA rizikos lokusus.

Tikslų nustatymas

Ekseterio (Didžioji Britanija) universiteto Ekseterio medicinos mokyklos Biomedicinos ir klinikos mokslų instituto Setho Sharpo vadovaujama mokslininkų grupė siekė HLA alelius ir jų sąveiką, taip pat neseniai atrastus ne HLA lokusus paversti patobulintais. T1D GRS, vadinamasis T1D GRS2, turi būti integruotas. Tyrėjai nori naudoti naują rezultatą, kad nustatytų diabeto potipius ir naujagimius, kuriems gresia T1D.

metodologija

Iš 6 481 paciento ir 9 247 kontrolinio asmens iš 1 tipo cukrinio diabeto genetikos konsorciumo mokslininkai išanalizavo genų lokusų variantus, pasitaikiusius tiek HLA regione, tiek visame genome ir susijusius su T1D. Jie modeliavo sąveiką tarp variantų, kurie žymėjo stipriai susijusius HLA haplotipus ir generavo šansų santykius, kad sukurtų patobulintą T1D GRS2.

Naudodami 387 pacientų, sergančių T1D, ir 11 885 pacientų, sergančių T2D, duomenis iš JK „Biobank“, mokslininkai patvirtino T1D GRS2. Jie taip pat vykdė modeliavimą, kad palygintų naujojo balo rezultatus su tradiciniais genetinės diagnostikos ir atrankos metodais.

Rezultatai

T1D GRS2 atsižvelgiama į 67 SNP ir sąveiką tarp 18 HLA-DR-DQ haplotipų derinių. Rezultate dabar yra daug daugiau DR-DQ haplotipų, netoliese esantys reguliavimo regionai, daugiau I klasės alelių ir HLA-DP alelių, kurie perteikia jautrumą T1D.

Nustatyta, kad T1D GRS2 yra labai diskriminuojantis visais T1D atvejais (plotas po kreive [AUC] 0,92; P <0,0001 palyginti su senesniais balais) ir dar efektyvesnis ankstyvam T1D (AUC 0,96).

Imituojant naujagimių atranką, T1D GRS2 buvo beveik dvigubai labiau nuspėjamas nei vien tik HLA genotipas ir 50% geresnis už dabartinius genetinius rodiklius, kurie naudojami prognozuojant T1D riziką visoje populiacijoje.

Išvada

Patobulintas T1D GRS, T1D GRS2, buvo nepaprastai vertingas klasifikuojant suaugusiųjų diabetą ir gerinant naujagimių patikrą. Atsižvelgiant į SNP genotipų ekonomiškumą, šis metodas suteikia didelį potencialą naudoti klinikoje ir T1D tyrimuose.

Autoriai gali įsivaizduoti, kaip naudoti naują balą atliekant atranką pagal populiaciją ir vėliau periodiškai tiriant antikūnų buvimą tik žmonėms, turintiems didelę genetinę riziką.

Tyrimo autoriai gavo dotacijas iš įvairių nekomercinių institucijų. Bendraautorė gavo finansavimą iš JK. Medicinos tyrimų tarybos institucinis pasitikėjimas koncepcijos programa, siekiant sukurti 10-SNP biochipą T1D genetiniam tyrimui bendradarbiaujant su „Randox“ kompanija.